食用菌菌絲繁殖快，易變異，菌種保存難度較大。現介紹幾種效果很好且簡單易行的方法。
　　1.液(ye)體(ti)石(shi)蠟(la)保(bao)存(cun)法(fa)選(xuan)用(yong)液(ye)體(ti)石(shi)蠟(la)，高(gao)壓(ya)滅(mie)菌(jun)後(hou)放(fang)入(ru)恒(heng)溫(wen)箱(xiang)中(zhong)數(shu)小(xiao)時(shi)，或(huo)幹(gan)燥(zao)器(qi)中(zhong)數(shu)日(ri)，用(yong)無(wu)菌(jun)吸(xi)管(guan)或(huo)注(zhu)射(she)器(qi)吸(xi)取(qu)液(ye)體(ti)石(shi)蠟(la)，注(zhu)入(ru)菌(jun)種(zhong)試(shi)管(guan)。注(zhu)入(ru)量(liang)應(ying)高(gao)出(chu)斜(xie)麵(mian)尖(jian)端(duan)1厘米左右。塞上棉塞，用蠟封好
，直立保藏在低溫處
，可保存5年。
　　2.麩fu皮pi保bao存cun法fa稱cheng取qu一yi定ding量liang的de麩fu皮pi，加jia水shui或huo營ying養yang液ye後hou拌ban勻yun即ji可ke使shi用yong。濕shi麩fu皮pi裝zhuang入ru試shi管guan，高gao壓ya滅mie菌jun後hou接jie入ru菌jun種zhong，放fang在zai適shi溫wen下xia培pei養yang。菌jun絲si體ti發fa育yu好hao後hou
，將jiang試shi管guan放fang入ru幹gan燥zao室shi溫wen下xia進jin行xing幹gan燥zao。幹gan燥zao後hou放fang在zai20℃以下幹燥處保存，可保存3―5年。
　　3.生理鹽水保存法將菌種接入馬鈴薯培養液中，250毫升三角瓶裝60毫升培養液，振蕩培養或每天搖動5―10次，培養5―7天，然後將形成的菌絲球移入裝有5毫升無菌生理鹽水的試管中，每管約移入4―5個菌絲球
，塞上棉塞，用蠟封好管口。置低溫下
，可保存1年。
　　4.麥粒保存法取優質小麥
，淘洗後浸入20℃水中泡5小時，稍加晾幹，裝管。裝入量以管長的1/4―1/3為宜。滅菌，趁熱搖散

，冷卻後接入菌絲體。適溫培養，至大多數麥粒上出現稀疏菌絲時終止培養。置於25℃以下幹燥處，可保存1―2年。