API離子源主要給出分子量信息，也可以通過一些條件限製獲得有限的結構信息，它又包括電噴霧電離源（ESI）、大氣壓化學電離（APCI）以及大氣壓光化學電離源（APPI）、大氣壓固相分析探針（ASAP）等。ESI的原理是：daicewujingyexiangfenli，tongguomaoxiguanjinrudianliyuan，beiliziyuandegaoyadianchangdianli，tongshizaituorongjiqihewendudegongtongzuoyongxiawuhua，zuizhongxingchengwuzhuangdedaidianyedi，suizherongjibuduanzhengfa，yedidetijibuduanbianxiao，dianhezaiyedizhongbuduanfuji，zuizhongzaifujidaoyidingchengdushi

，fasheng“庫倫爆炸”，把液滴炸碎，在多次爆炸後，待測物最終被離子化。ESI源適合於離子型和極性分析物，靈敏度高，能給出分子量的信息
，是目前最常用的離子源；但是這種離子源一般最大能允許2mL/min的de純chun水shui相xiang通tong過guo，否fou則ze不bu能neng夠gou很hen好hao地di霧wu化hua並bing去qu除chu溶rong劑ji，並bing且qie如ru果guo待dai測ce物wu比bi較jiao複fu雜za切qie液ye相xiang分fen離li不bu利li的de情qing況kuang下xia，會hui產chan生sheng離li子zi抑yi製zhi，最zui終zhong降jiang低di檢jian測ce靈ling敏min度du。

APCI的原理是：待dai測ce物wu通tong過guo毛mao細xi管guan噴pen霧wu來lai霧wu化hua
，同tong時shi在zai高gao溫wen和he脫tuo溶rong劑ji氣qi的de共gong同tong作zuo用yong下xia快kuai速su蒸zheng發fa溶rong劑ji
，然ran後hou電dian暈yun針zhen尖jian端duan高gao壓ya放fang電dian，使shi經jing過guo電dian暈yun針zhen的de待dai測ce物wu發fa生sheng電dian離li。

其優點在於使用方便，耐用性好，靈敏度高
，可以匹配高流速，適合於非極性至弱極性樣品，小分子樣品以及抗菌素和堿性藥物等。

其缺點在於有可能發生熱裂解，有低質量端的化學噪聲大，有限的結構信息。

因此ESI和APCI是互補的。

近年來市場上有廠家將ESI和APCI結合起來
，推出ESCI複合離子源，其優點在於提高工作效率
，能夠一次給出ESI+、ESI-
、APCI+和APCI-四種電離方式的離子流圖。其缺點在於要求各電離方式之間的切換速度要求比較短
，否則在切換時有可能會造成漏檢。

大氣壓固相分析探針（ASAP）是近年來需求比較大的離子源


，其優點是能夠免除前處理，對於膏狀物、粘度大的物質、易yi發fa泡pao的de物wu質zhi等deng液ye相xiang不bu易yi分fen離li的de物wu質zhi來lai說shuo，可ke以yi直zhi接jie進jin入ru質zhi譜pu檢jian測ce
，避bi免mian經jing過guo液ye相xiang，大da大da提ti高gao了le工gong作zuo效xiao率lv。對dui於yu化hua學xue合he成cheng實shi驗yan來lai說shuo，還hai可ke以yi接jie近jin實shi時shi監jian測ce反fan應ying過guo程cheng，非fei常chang方fang便bian。

FAB離子化能力強
，適用於強極性
、揮發性低、熱穩定性差和相對分子質量大的樣品
，對非極性樣品靈敏度下降、低質量區以下產生較多幹擾峰。

MALDI的準分子離子峰很強，幾乎沒有碎片離子，可以直接分析蛋白質酶解後多肽混合物，對樣品中雜質的耐受量較大，適用於多肽、蛋白質、糖蛋白
、DNA片段
、多糖及其他生物技術產品的分析。API源是我們最常用的液質離子源。

而對於氣相質譜（GS/MS）來說
，主要有電子轟擊電離源（EI）、化學電離源（CI）和場致電離源（FI）及場解吸電離源（FD）。

EI是利用一定能量的電子與氣相中的樣品分子相互作用（轟擊）
，使分子失去電子，電離成離子。當分子離子具有的剩餘能量大於其某些化學鍵的鍵能時，分子離子便發生碎裂

，生成碎片離子。

其優點在於它是非選擇性電離，隻要樣品能氣化都能夠離子化，且離子化效率高、靈敏度高；能夠提供豐富結構信息
，是化合物的指紋譜

；有龐大的標準譜庫供檢索。

其缺點在於不適用於難揮發、熱不穩定的樣品，而且隻能檢測正離子，不檢測負離子。CI是(shi)指(zhi)引(yin)入(ru)一(yi)定(ding)的(de)反(fan)應(ying)氣(qi)進(jin)入(ru)離(li)子(zi)化(hua)室(shi)，反(fan)應(ying)氣(qi)在(zai)具(ju)有(you)一(yi)定(ding)能(neng)量(liang)的(de)電(dian)子(zi)流(liu)的(de)作(zuo)用(yong)下(xia)電(dian)離(li)或(huo)裂(lie)解(jie)，生(sheng)成(cheng)的(de)離(li)子(zi)和(he)反(fan)應(ying)氣(qi)分(fen)子(zi)進(jin)一(yi)步(bu)反(fan)應(ying)或(huo)和(he)樣(yang)品(pin)分(fen)子(zi)發(fa)生(sheng)離(li)子(zi)分(fen)子(zi)反(fan)應(ying)
，通(tong)過(guo)質(zhi)子(zi)交(jiao)換(huan)使(shi)樣(yang)品(pin)分(fen)子(zi)電(dian)離(li)。

其優點在於可以通過控製反應，根據離子親和力和電負性選擇不用的反應試劑
，用於不同化合物的選擇性檢測。

其缺點在於也不適用於難揮發和熱不穩定樣品，譜圖重複性不如EI圖譜，而且反應試劑容易形成較高的本底

，影響檢測限。

FI和FD是一種軟電離方式，由一個電極和一組聚焦透鏡組成，形成高達幾千伏的強電場
，使氣態分子的電子被拉出而電離。

其優點在於幾乎沒有碎片離子
，沒有本底，圖譜很幹淨。

缺點在於僅適用於扇形磁場質譜和飛行時間質譜儀
，四級杆質譜和離子肼質譜都不能配置FI和FD源，而且高壓容易產生放電效應，操作也更難一些。EI源是我們最常見的氣質離子源。