細菌分類學上，腸球菌屬早期並不存在，現今的一些菌種本歸屬於鏈球菌屬,1989年，依據Facklam和Collins的分類
，腸球菌屬內包括十二個種及一個變異株
，它們是：

　　糞腸球菌（E.faecalis） 屎腸球菌（E.faecium)

　　鳥腸球菌(E.avium) 酪黃腸球菌(E.casseliflavus)

　　堅忍腸球菌(E.durans) 雞腸球菌E.galinarum)

　　芒地腸球菌(E.mundii) 惡臭腸球菌(E.maladoratum)

　　希拉腸球菌(E.hirae) 孤立腸球菌（E.solitarius）

　　棉子糖腸球菌(E.raffinosus) 假鳥腸球菌(E.pseudoavium)

　　糞腸球變異株(E.faecalis var)。

　　糞腸球菌為該屬中最常見的即為代表種。該屬通常指糞便來的可以用氮鈉分離鑒定的一群革蘭氏陽性球菌。由於腸球菌的菌種均含有Lancefield的D群抗原，亦稱D群糞腸球菌或D群腸球菌。腸球菌的DNA G+C含量33%-39%mol。

　　腸chang球qiu菌jun普pu遍bian存cun在zai於yu自zi然ran界jie，一yi般ban棲qi居ju在zai各ge種zhong溫wen血xue和he冷leng血xue動dong物wu的de腔qiang腸chang，甚shen至zhi昆kun蟲chong體ti內nei
，也ye是shi健jian康kang人ren體ti的de上shang呼hu吸xi道dao
，口kou腔qiang或huo腸chang道dao的de常chang居ju菌jun。本ben菌jun可ke以yi引yin起qi心xin內nei膜mo炎yan，膽dan囊nang炎yan，腦nao膜mo炎yan，尿niao路lu感gan染ran及ji傷shang口kou感gan染ran等deng多duo種zhong疾ji病bing。在zai人ren類lei糞fen便bian中zhong的de數shu量liang僅jin次ci於yu大da腸chang菌jun群qun，每mei克ke成cheng人ren的de糞fen便bian中zhong約yue含han２×10⁸個。由於此汙染指示菌比較大腸杆菌對外界環境溫度適應性強
、抵di抗kang力li強qiang及ji耐nai受shou性xing強qiang，甚shen至zhi可ke以yi與yu多duo種zhong抗kang生sheng素su相xiang抵di抗kang和he生sheng長chang營ying養yang要yao求qiu不bu高gao

，因yin此ci在zai自zi然ran界jie分fen布bu廣guang


，存cun活huo力li持chi久jiu。在zai無wu糞fen便bian汙wu染ran的de環huan境jing中zhong較jiao大da腸chang菌jun更geng易yi發fa現xian，所suo以yi
，即ji使shi檢jian出chu腸chang球qiu菌jun也ye沒mei有you糞fen便bian汙wu染ran的de指zhi示shi作zuo用yong。此ci外wai，即ji使shi在zai冷leng凍dong，幹gan燥zao性xing和he經jing中zhong等deng強qiang度du加jia熱re處chu理li的de食shi品pin中zhong檢jian出chu腸chang球qiu菌jun也ye不bu能neng提ti示shi腸chang道dao致zhi病bing菌jun的de存cun在zai，因yin為wei腸chang球qiu菌jun比bi沙sha門men氏shi菌jun，致zhi病bing性xing大da腸chang杆gan菌jun抵di抗kang性xing及ji存cun活huo率lv均jun高gao。

　　食品微生物檢驗主要針對在１０℃和４５℃下可生長發育的糞腸球菌與屎腸球菌，二者在生化特性
、ＤＮＡ雜交結果有明顯不同。在４５℃條件下，用含疊氮鈉成分的培養基檢測此類指示菌是其主要特征。

　　目mu前qian該gai菌jun多duo作zuo為wei生sheng活huo飲yin用yong水shui，管guan道dao水shui和he一yi些xie水shui質zhi的de指zhi示shi菌jun。衛wei生sheng學xue家jia認ren為wei，腸chang球qiu菌jun類lei似si於yu大da腸chang菌jun群qun的de生sheng態tai活huo動dong
，但dan其qi對dui惡e劣lie的de外wai環huan境jing和he冷leng凍dong條tiao件jian具ju有you較jiao強qiang的de抵di抗kang力li
，作zuo為wei監jian測ce水shui質zhi衛wei生sheng，環huan境jing衛wei生sheng質zhi量liang的de汙wu染ran指zhi標biao更geng具ju有you衛wei生sheng學xue意yi義yi。另ling據ju有you關guan報bao道dao
，大da量liang的de（１０⁹以上）腸球菌可以引起食物中毒
，作為一個有衛生學意義的細菌（該菌的汙染在某些食品中也常被發現）
，有些國家已經製定了針對腸球菌汙染限量標準
，大多製定在０／克～１０⁵／克範圍內。從預防食物中毒方麵，保障人民身體健康考慮
，借鑒國外標準，製定適宜的汙染限量指標
，應盡快擺到議事日程上來。

１、形態與染色

　　腸球菌屬的細菌為革蘭氏陽性球菌
，多數菌種成雙或呈短鏈狀排列；一般無芽胞，無莢膜，少數菌種有鞭毛，陳舊培養物或在厭氧狀態下有時呈革蘭氏陰性。

２

、培養特性

　　在普通瓊脂及麥康凱瓊脂上形成小菌落，在血瓊脂上形成較鏈球菌稍大的菌落
，光滑
、較濕潤、易乳化，依據種的不同，α、β或γ溶血均可出現。在液體培養基中呈均勻渾濁生長，也較易形成長鏈。需氧或兼性厭氧，最適生長溫度37℃，最適pH為4.7-7.6
，屬內各菌種均能在６.5%氯化鈉肉湯,pH9.6葡萄糖肉湯及４５℃生長，個別菌種在50℃時生長快。

３、抗原結構

　　Lancefied血清係統屬D群，其特異性抗原決定簇是位於細胞壁中的甘油壁酸，本質上是多糖類，含有N-乙酰己糖胺。

４、生化反應

　　過氧化氫酶呈陰性，能分解葡萄糖、麥芽糖生成酸，多數菌株分解甘露醇；膽汁七葉苷水解、萬古黴素敏感性及咯烷基芳基酰胺酶均為陽性；耐一定程度的酸堿、耐鹽和４０％的膽鹽
；結合Ｄ群抗血清進行血清學鑒定可用來區分腸球菌與鏈球菌，乳球菌屬。依據甘露醇
、山梨醇

、山梨糖產酸及精氨酸脫氨基四個關鍵性的生化生理實驗
，可將腸球菌分為三個群。